江苏师范大学研究生教育始于1979年。1981年成为全国首批硕士学位授予单位。1996年获得以毕业研究生同等学力申请硕士学位授予权。2003年获得教育硕士专业学位授予权。2010年获得推荐免试攻读硕士学位研究生资格。2012年获批“服务国家特殊需求博士人才培养项目”（生物学），2013年开始招收博士生。2013年开始招生外国留学生。目前已有1个“国家甘薯产业体系技术遗产育种与生物技术”博士人才培养项目，35个一级学科硕士点，16个专业学位授予权点。

近年来，我校研究生获得“挑战杯”全国大学生课外学术科技作品竞赛一等奖、“创青春”全国大学生创业大赛金奖、全国研究生移动终端应用设计创新大赛一等奖等国家级奖项。  

为适应研究生教育事业的发展，1979年学校在科研处下设立研究生科。1997年成立研究生部，挂靠科研处。2000年正式成立研究生处。2013年更名为研究生院。